Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms