Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms