Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms