Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms