Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL1Q9NSC2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms