Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms