Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms