Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms