Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms