Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms