Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRHQ9HD43 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms