Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms