Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00574Q9H8X3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms