Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF41Q9H4P4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF41Q9H4P4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms