Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SENP3Q9H4L4 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms