Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTIF3Q9H2K0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTIF3Q9H2K0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms