Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms