Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZYG11BQ9C0D3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZYG11BQ9C0D3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms