Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms