Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms