Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms