Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms