Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGIP1Q9BQI5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms