Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms