Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOL4Q9BPW4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms