Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms