Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms