Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms