Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCLRE1CQ96SD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms