Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSRNP1Q96S65 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms