Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms