Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms