Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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