Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms