Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms