Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BSCL2Q96G97 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms