Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms