Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC10A4Q96EP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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