Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPUSD4Q96CM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPUSD4Q96CM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD4Q96CM3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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