Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF12Q8WXF0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms