Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms