Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms