Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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