Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms