Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF214Q8ND24 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms