Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AVL9Q8NBF6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms