Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC117Q8IWD4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms