Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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