Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NLRP13Q86W25 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP13Q86W25 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms