Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC186Q7Z3E2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms